Zhang Yan 교수의 연구팀은 슈퍼 인핸서 슬롯 사이트 추천위한 새로운 자원에서 중요한 진전을 이루었습니다

게시자 : Ma Wenjun게시 : 2019-11-12보기 :2871

2019year10Month31일본 "핵산 슬롯 사이트 추천》 (if 11.147) Zhang Yan 교수의 생명 과학 및 기술 슬롯 사이트 추천 그룹의 새로운 업적을 온라인으로 출판했습니다.SEA 버전 3.0:슬롯 사이트 추천 엔진의 포괄적 인 확장 및 업데이트》. 슬롯 사이트 추천 인핸서 (Super-Enhancer,SE)는 게놈에서 많은 수의 인핸서에 의해 풍부한 전사 조절 영역이다. 유전자 발현을 크게 활성화 할 수 있고 조직 특이성이 높다. 개발, 종양 등에 중요한 역할을합니다. Super Enhancer 관련에 대한 진행 상황과 심층적 인 슬롯 사이트 추천 촉진하기 위해 연구팀은 최신 버전의 Super Enancer 데이터베이스를 개발했습니다.Seav.3.0(http : //sea.edbc.org), 슬롯 사이트 추천 향상 서브 쿼리, 다운로드, 시각화 및 분석을 통합하는 포괄적 인 플랫폼, 표준 쿼리, 게놈 브라우저, 개인화 된 분석 도구 및ses데이터 다운로드.데이터베이스가 저장되었습니다11164,545Super Enhancers (인간, 마우스, Drosophila, 선충, Zebrafish, 닭, 침팬지, rhesus monkey, 양, Xenopus 및 Spineback) 및3,361,785전형적인 인핸서.염색질 상호 작용,SNPS, 전사 인자 결합 부위 및SPCAS9대상 사이트의 정보. 평가를위한 Shannon 엔트로피 기반 도구 포함ses세포 유형의 특이성. 슬롯 사이트 추천원이 통과했습니다바다 V.3.0Genome Browser,Hi-C데이터SES공간 상호 작용 시각화 및SES관련 유전자의 온라인 기능적 농축 분석.Zhang Yan 교수는 다음과 같이 지적했습니다."Super Enhancer는 세포 인식 유전자의 중요한 조절기입니다. 조절 메커니즘에 대한 심층 분석은 줄기 세포 다 능성, 방향 분화 및 암의 중요한 조절제를 드러내는 데 도움이 될 것입니다. 특정 암 유형에서 슬롯 사이트 추천 인핸서의 식별 및 심층 분석은 개별 의료 서비스를위한 중요한 목표를 제공 할 것입니다.바다 v. 3.0여러 종에 사용할 수있는 모든 것을 제공SE포괄적 인 정보 데이터베이스 및 특히 개발 및 질병과 관련된 슈퍼 인핸서의 연구를 용이하게 할 것입니다."

Zhang Yan Education이 논문의 해당 저자에 따르면, 박사 과정 학생 Chen Chuangeng과 Zhou Dianshuang은 묶인 첫 번째 저자입니다. 연구 그룹의 박사 학위 및 석사 학생들은 데이터 수집 및 처리 프로세스에 많은 기여를했습니다. 이 프로젝트는 중국 국립 자연 과학 재단 (National Natural Science Foundation of China)에 의해 자금을 지원 받았다.

논문 링크 :https : //academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkz1028/5610346


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