플래티넘 슬롯 전에 마우스에서 새로운 긴 비 코딩 플래티넘 슬롯의 시스템 식별이 중요한 진전을 이루었습니다

11 월 27 일, 우리 학교의 School of Life의 Lu Jie 박사는 "분자 유전자 및 유전체학"온라인에서 온라인으로 마우스 사전 플래티넘 슬롯 배아 개발에 관여하는 4438novel lincrnas의 식별 논문을 발표했습니다.

이 연구는 마우스에서 사전 플래티넘 슬롯 발달로 발현 된 다수의 긴 유전자 간 비 코딩 RNA (LincRNA)를보고했다. 사전 플래티넘 슬롯 발달 과정은 모체 잔류 전 사체의 분해와 zygotic 게놈 활성화라고 불리는 intrazygotic 부모의 전 사체의 생성을 동반한다. 사전 플래티넘 슬롯 개발 과정에서, zygote는 여러 분열을 겪어 플래티넘 슬롯까지 다세포 유기체의 개발을위한 기초를 제공한다. 그러나, 단일 세포 시퀀싱의 기술은 점점 더 성숙 해지고있어 플래티넘 슬롯 전에 개발 된 전사 조성물을 해결할 수있다. 이 연구는 전 사체 재구성을 위해 단일 세포 RNA-Seq 데이터를 사용하고 4438 가상 LincRNA를 확인했습니다. 알려진 유전자 주석과 통합 된, 사전 플래티넘 슬롯 개발 중에 발현 된 5808 LincRNA를 포함하는 기준 카탈로그가 확립되었다. 확립 된 파이프 라인을 사용하여 LincRNA를 예측하여 이러한 LincRNA를 분석하여, 새로운 LincRNA는 주석이 달린 LincRNA와 유사한 게놈 특성을 가지며 염색질 변형과 같은 기능적 게놈 데이터에 의해 확인되었다. 또한, 클러스터링 분석은 접합체의 첫 번째 분할 동안, 전 사체 발현 패턴의 근본적인 변화가 접합체 동안 발생했으며, 접합체 동안 차등 적으로 발현 된 lincRNA 및 프로모터 메틸화의 변화는 부정적인 상관 관계를 보여 주었고, 이는 임플란트 전에 메틸화에 의해 조절되는 것을 나타냅니다. 사전 플래티넘 슬롯 개발 중에 표현 된 마우스 lincrNA는 추가 기능 연구를위한 중요한 자원입니다. 마우스에서의 플래티넘 슬롯 발달 메커니즘에 대한 연구와 인간의 보조제에 대한 연구조차 중요한 기초를 제공했습니다.

발달 생물학 연구소는 국립 자연 과학 재단 (플래티넘 슬롯-SEQ 데이터에 기초한 배아 개발과 관련된 LNC플래티넘 슬롯의 식별 및 기능적 연구)의 지원하에 Linc플래티넘 슬롯에 대한 생물 정보학 및 실험적 연구에 대한 연구를 수행했다. "핵산 연구"(IF : 8.8), "PLOS ONE"(IF : 3.5), "분자 유전학 및 유전체학"(IF : 2.8) 및 "분자 및 세포"(IF : 2.2)와 같은 저널에서 많은 중요한 연구 결과를 발표했습니다.

기사 링크 :http : //link.springer.com/article/10.1007/s00438-014-0952-z